1. 职称评定：在职博士学位证书在部门的职称评定中具有重要作用。例如，在一些专业性较强的部门，如科研机构、高等院校等，拥有在职博士学位的人员在职称晋升时会更具优势。因为博士学位往往代表着在某一领域具有深入的研究和专业知识，这对于评定高级职称是非常重要的考量因素。

2. 科研项目申请：部门会有各种科研项目的申报，在职博士的学位证书可以作为申请这些项目的重要资质证明。例如，一些国家级或省级的科研基金项目，要求申请人具有较高的学历和研究能力，在职博士学位证书能够满足这些要求，增加申请成功的概率。

3. 人才引进：为了提升部门的专业能力和研究水平，一些地方会出台人才引进政策，吸引具有博士学位的人才加入。在职博士学位证书可以作为人才引进的重要依据，享受相应的优惠政策和待遇。

4. 内部晋升：在部门内部，拥有在职博士学位的员工在晋升到高级管理或专业技术岗位时，学位证书可以作为其专业能力和综合素质的有力证明，有助于在竞争中脱颖而出。

5. 政策制定和咨询：在一些涉及专业领域的政策制定和咨询工作中，拥有在职博士学位的人员可以凭借其专业知识和研究能力，为部门提供专业的意见和建议。例如，在教育、科技、卫生等领域的政策制定过程中，相关专业的在职博士可以参与其中，发挥自己的专业优势。

需要注意的是，在职博士学位证书在部门的应用情况可能会因地区、部门和具体政策的不同而有所差异。在具体应用时，还需要结合当地部门的相关规定和要求来确定。